Le troisième jeu de la trilogie Objets cachés de Nightmares from the Deep. Nightmares from the Deep: Davy Jones est le dernier chapitre de la trilogie des pirates Nightmares from the Deep et raconte l'histoire de l'intrépide dépositaire de musée Sarah Black et de sa fille Cory. Après avoir découvert de mystérieuses notes confirmant la légende de Davy Jones, Sarah convoque une conférence de presse pour révéler au monde entier que le vieux diable de la mer et son trésor mythique sont bien réels, cachés dans une île mystérieuse. Soudain, le galion de l'infâme pirate apparaît à l'horizon et Davy Jones lui-même fait irruption dans le musée pour kidnapper Sarah et sa fille. Sarah et sa fille sont toutes deux jetées dans le navire du navire de Jones. Ils parviennent à s'échapper et, tout en cherchant un moyen de retourner à la côte, ils découvrent de sombres secrets sur les origines d'un autre monde du navire. Mais avant de pouvoir s'échapper sur l'un des canots de sauvetage, ils sont capturés et pour sauver sa mère, Cory accepte de signer un pacte noir avec Davy Jones ...